思科于1994年进入中国市场，目前在中国拥有员工超过3400人，分别从事销售、客户支持和服务、研发、业务流程运营和IT服务外包、思科融资及制造等工作领域。思科在中国设立了多个业务分支机构，并在上海建立了一个大型研发中心。
2008年4月16日，思科董事会主席兼首席执行官约翰？钱伯斯再次访华，在北京宣布了思科在中国的下一阶段公司发展战略和蓝图。作为“创新及可持续发展”战略的重要一步，思科将继续加强与中国政府和产业的合作，并与中国在经济、社会及环境等各个层面的发展目标相契合。在钱伯斯访华期间，思科与国家发展和改革委员会及商务部分别签署合作备忘录，包括加大在研发、教育、采购、投资和培训等方面的投入。
除了技术研发和业务推进，思科还致力于激发中国本土的创新文化，思科已经针对中国本土的多家企业投入了7亿美元，并将在未来五年增加3.5亿美元相应投入。同时，思科公司也十分重视帮助中国教育和培养网络人才，到2011年，思科将在众多高等职业学院中新增300所思科网络技术学院，参与思科网络技术学院培训的学生总数将新增10万人。2009年，思科系统（中国）公司第三次获得由北京大学管理案例中心和《经济观察报》颁发的“年度中国最受尊敬企业”奖项。此外，思科连续四年获得21世纪报业集团评选的“年度中国最佳企业公民”大奖。
2010年1月，思科宣布将把亚太区及日本区重新划分为三个大区，以更好地促进该地区各市场的战略制定和资源投入。作为原亚太区组成部分的中国内地、香港和台湾，将组成独立的思科大中华区。 鉴于中国经济发展的规模和增长速度，以及思科对中国业务的重视程度，单独设立大中华区是思科中国战略的又一重大举措。
2013年美国 “棱镜门”揭秘者斯诺登称，美国国家安全局通过思科路由器监控中国网络和电脑。而思科参与了中国几乎所有大型网络项目的建设。
据称，美国通信巨头思科参与了中国几乎所有大型网络项目的建设，涉及政府、海关、邮政、金融、铁路、民航、医疗、军警等要害部门的网络建设，以及中国电信、中国联通等电信运营商的网络基础建设。
然而思科却是美国政府和军方的通信设备和网络技术设备主力供应商。安全专家担心一旦战争爆发，美国政府极有可能利用思科在全球部署的产品，发动网络战，对敌国实施致命打击。
事实上，去年美国封杀华为、中兴之时，就不断有安全专家呼吁政府应重视我国的网络安全问题。“棱镜门”事件是一个更大的警示，或许接下来我国将会对网络安全立法，对政府、央企、军方等采购的国产化作出明文规定。
